靈魂駭客2游戲在最終章的流程中的對手是八咫烏的刺客。齊鑰匙后會在中央與Aion的意識體進行戰斗。擊敗意識體后繼續前進，穿過最后的大門開始最終Boss戰。最后的尾聲，此后林檎留在了孤兒院照顧孩子們。

游戲結局介紹：

靈魂駭客2游戲在最終章的流程中的對手是八咫烏的刺客。

此處會出現提升靈魂等級的選項。需要注意的是，用物理和槍擊傷害攻擊Boss都會導致他召喚的惡魔進行反擊。一路上的選擇選項都不會對劇情造成太多影響。 抵達最上層，前進幾步即可觸發劇情，出現了新的敵人。

此處會出現提升靈魂等級的選項，需要注意。 一番對話后自然是迅速進入戰斗。 需要注意的是，用物理和槍擊傷害攻擊Boss都會導致他召喚的惡魔進行反擊。 擊敗敵人后依舊會出現提升靈魂等級的選項，需要注意。

之后一路穿過骨頭大門，前往菲格的所在地。 一路上無論是否選擇認同都不會對劇情造成太多影響。 湊齊鑰匙后會在中央與Aion的意識體進行戰斗(上圖六角形標記)。 擊敗意識體后繼續前進，穿過最后的大門開始最終Boss戰。

注意：進入大門后將無法保存游戲進度，建議在此之前盡可能準備齊全，完成支線與各項成就。

進入大門，與化身電靈Aion的菲格對話。 原來菲格的想法是利用Aion的靈魂駭入，加上梵尼迅系統和圣約的加成改變世界。 雙方自然是談不攏的，一番對話后進入第一輪Boss戰。

敵人的血量過半后，會進入第二階段，召喚出數個分身進行戰斗。 分身的屬性可以通過分身顏色進行判斷，逐個擊破后即可擊敗菲格。 擊敗菲格后進入第二階段，菲格再次轉換了形態。 接下來要面對的敵人已經不再是菲格，而是正經的電靈Aion。

Boss對所有類型的傷害均有抗性，建議使用萬能屬性或是削減抗性技能造成傷害。 不過即便沒怎么打它，每過一段時間它都會自動轉換弱點屬性。

需要格外注意的是，Boss每次行動都能夠行動數次。 擊敗Boss后，菲格再次出現，但沒多久便消逝了。 之后眾人回到安全屋，總結了一番后各自走上屬于自己的道路。

最后的尾聲，此后林檎再也沒有去過中樞，留在了孤兒院照顧孩子們。 在職員表結束播放后可以保存通關存檔并開始二周目。