寶可夢傳說阿爾宙斯并沒有沿用寶可夢系列的經典玩法，而是采用了開放世界玩法。類似此前寶可夢劍盾中的曠野地帶，但是地圖放大至過去的神奧地區(qū)。

《寶可夢傳說：阿爾宙斯》的冒險舞臺是過去的神奧地區(qū)。神奧地區(qū)是個頗具特色的地方，中央聳立著天冠山，并且擁有廣闊的大自然，同時也是《寶可夢鉆石·珍珠》的冒險舞臺。

而這次的故事則是發(fā)生在很久以前的神奧地區(qū)，并且當時還沒有寶可夢訓練家和寶可夢聯(lián)盟的概念。